报道说，从疫苗企业收取好处的基层防疫和疾控部门人员，往往也同时向多家公司收取“好处费”，可见医药采购领域的贪腐问题远超一家企业的单独行为。

舆论质疑，疫苗从研发到临床再到最后上市销售，都要执行严格的批签发制度，而长生生物能在短时间内形成行业绝对优势地位，这本身就存在许多疑点。此外，长生生物执行国企转制时，以低于市场价格卖给了当时的国企高管，这是否存在违规操作，也为人们所广泛讨论。

人民网前天刊登评论质问：“假疫苗横行，那就是政府职能部门失职，就该有人对此负责。如果做不到，设立这个部门干嘛？”

北京航空航天大学公共管理学院教授任建明接受《联合早报》访问时说，中国的反腐败工作向来按照高层领导关注的重点领域来进行，而医疗卫生领域多年来不太受重视，因此成了打击腐败的盲区。

任建明说，当局应该抓准“问题疫苗”事件的契机，一劳永逸解决疫苗采购领域的深层腐败。

他提出：“问题疫苗卖了那么多年，为什么一直没有发现它不合格？这次除了彻查企业，也要对食药、防疫等监管部门进行责任追究，对失职渎职的人员进行处分，才能对人民有所交代。”