中共十九届三中全会提出，深化党和国家机构改革的首要任务是要确保党的领导“全覆盖”，有分析认为，这表示此次改革将涉及党政机构的合署。

不过受访学者担心，如果“党统揽全局”渗透到行政管理层面，可能会重现过去以党代政、党政不分的风险。

根据三中全会公报，深化党和国家机构改革的首要任务是完善坚持党的全面领导制度，加强党对各领域各方面工作领导，“统筹设置党政机构”。此次改革最终要形成总揽全局、协调各方的党的领导体系，以及职责明确、依法行政的政府治理体系。

学者分析，上述原则暗示此次改革可能超越以往的大部制改革。

此前有消息说，国土部、环保部可能组建成国土资源环境保护部；银监会、证监会、保监会合并为金融监管会；工商总局、质检总局等合并组建市场监管总局等。

北京理工大学教授胡星斗接受《联合早报》访问时说：“从三中全会的公报来看，党和国家机构的整合更可能以党政合署的方式进行。”

“目前党和政分别有两套系统，但两者的职能其实非常接近。例如，中宣部和文化部，一个是党的系统、一个是行政系统。如果进行整合，不仅可以避免党政重复、提高效率，而且每个机构内都有党组织，也能体现党的全面领导。”

实际上，中共总书记中领导人在去年10月召开的中共十九大上做报告时就提到，要在省市县对职能相近的党政机关“探索合并设立或合署办公”。

北京师范大学政府管理研究院院长唐任伍则提出，分别隶属于国务院和中共的各个研究室、研究中心也可能进行重组。

不过独立时评人陈杰人警告，党政合署若把握不当，可能会走向党代替政府、代替企业、代替群团的趋势。

他说：“加强党的领导固然是宪法规定的内容，但这种领导应该更多体现在大政方针和政治方向上。如果在企业经营管理、群团组织、社会组织的具体业务也用党委来代替职业管理队伍，恐怕会产生不可预测的风险。”

对此，胡星斗认为，只要对党政职能做出明确划分，就可避免党政不分的问题。

事实上，三中全会公报就提到，此轮改革要“增强党的领导力，提高政府执行力”。这就表示，中共将负责顶层设计和意识形态工作，政府则负责执行党的布置。

另一方面，此次深化党和国家机构改革是一项重大任务，唐任伍说，中共上月召开二中全会讨论修改宪法，建议删除国家主席连续任职不得超过两届的内容，虽然引起了争议，但从更大的层面看，中国国家主席中领导人若能在2023年两届任职期满后继续留任，有利于中国稳步推进改革布局。