该案相关被告还包括前立委蔡正元、蔡妻洪菱霙、蔡的岳父洪信行，检方另依刑法业务侵占、公益侵占、背信、洗钱防制法之洗钱、商业会计法之故意遗漏会计事项不为记载致使财务报表发生不实结果等罪提起公诉。

国民党：有政治指挥办案之感

马英九办公室发言人徐巧芯表示，蔡英文政府为转移施政不佳的焦点，令北检以“博取声誉”这种推测字眼起诉马英九，违背起诉应本于事实的铁律，就等着年底地方选举被民众唾弃。

国民党发表声明指出，该案早已历经特侦组五任检察官、三任检察总长等长达10年侦查结案，确认并无不法之事，却在民进党政府上台后重启调查，难免让人有政治指挥办案之感。

国民党呼吁检方，如果担任政治势力的打手，只是羞辱司法独立与公正的招牌，希望司法能够明察勿纵，还马清白，也希望各界勿受不实说法所影响。