他指出，弊案初起时，民进党因招标工作在马政府时期发生而对国民党“打的很凶”，但随着录音档曝光，并牵扯出庆富公司董座陈庆男“蓝绿通吃”的复杂政商关系后，绿营自知很难从弊案中脱身。

根据台湾网络媒体《上报》报道，陈庆男“一直是民进党南部大金主”，并且是在前总统陈水扁执政期间，从远洋渔船建造以及渔产加工产业，踏入维修海军军舰与建造巡逻舰的市场。报道也指出，过去曾向台湾军售的法国军方或国防工业厂商来台拜会，一定造访庆富集团，因为“法方相信陈庆男是上达天庭的人物”。

另一方面，由于庆富的营运总部设在民进党堡垒高雄，陈庆男10多年前更为当时参选高雄市长的陈菊举办助选餐叙拉抬选情，再加上陈菊爱将、民进党立委刘世芳被指曾为庆富护航，以及高雄市政府掌控的高雄银行过去对庆富放贷担保引发质疑，以陈菊为代表的民进党新潮流派系和“高雄帮”因此卷入此案的泥沼中。

施正锋说：“现在高雄立委、市长和庆富纠缠不清，肯定影响民进党内部蔡英文跟新潮流的关系，但蔡英文不敢碰新潮流，况且她还需要新系的支持，所以双方不至于因为追究责任而撕破脸。”

尽管猎雷舰案不断烧向蔡政府，在野的国民党却未因此能够置身事外。国民党前立委孙大千指出，猎雷舰案横跨蓝绿两朝，从得标、联贷、乔地、拨款到纾困的漫长过程，“绝非一党或是一人可以只手遮天，一路护航到底”。也就是说，许多蓝绿的政治人物在不同时期，分别扮演重要角色，国民两党都与弊案脱不了关系。

不过，台湾战略学会理事长、淡江大学兼任教授王崑义认为，现在毕竟是民进党执政，若弊案处理不当，对绿营杀伤力绝对比国民党更大。

他说：“民众的信任度会递减，执政者的威信会因此被扫光，蔡英文寻求连任会有很大的冲击。只要立委、名嘴继续炒作，就会直接影响地方选举，像2014年的太阳花学运就直接影响当年国民党县市长的选举结果一样。”

施正锋推测，民进党政府为让事件止血，恐怕会推国防部长冯世宽“出来扛罪”。“他（冯世宽）应该不会立刻下台，而是循着明年农历新年期间的内阁改组出局。”