据中国经营报消息，多位知情人士向该报记者表示，确实曾发生卷宗丢失情况：在作出判决前一年的2016年11月下旬，该案二审全部卷宗一次性丢失，事发地点正是审理该案的有关单位。在丢失前的20多天，赵发琦公开实名举报陕西省主要领导干预该案，并指责此前有司枉法裁判。

陕北千亿矿权案二审逾6年时间：2011年3月，陕西省高院推翻原一审判决，认定原被告双方所签合同行为违反省政府21次常务会议纪要精神，其行为实施将损害国家利益，应为无效合同；2017年12月21日，最高人民法院对千亿矿权案宣判，维权12年的民企凯奇莱"胜诉"。东方网·纵相新闻记者获悉，二审由最高人民法院进行，卷宗丢失事件也发生在最高人民法院。

中国经营报报道称，审理单位在发现卷宗丢失后，曾多方寻找，并发现事发时监控为黑屏，随即便逐级汇报至院主要负责人。但过去两年里，有关单位未对此事进行报案，也未展开内部调查，更未对任何人进行查处，卷宗至今无下落。

崔永元在微博上质疑最高法院不作为，他表示，你们那里能进去盗贼吗？连老鼠都进不去。最高院可以丢卷宗吗？而且只丢这个案子的，而且只丢最重要的一本，而且丢的时候监控坏了，而且你们想再造一本。

中国经营报报道称，2010年时，媒体曾曝光陕西省政府向审理机关发密函干预此案。记者核实，此次干预，实际系陕西省政府应邀去函。