这次论坛开幕前，山东非法疫苗案爆发。在分论坛上，面对众多媒体记者，吴浈说，“我知道大家是奔着我来的”。他当时表示，山东疫苗在流通过程中确实存在漏洞，疫苗是预防性制品，不该对注射的健康人造成身体伤害。食药监总局和公安部、国家卫计委正密切配合，一定会把山东疫苗的事件处理好。

有记者追问，“你觉得疫苗安全吗？”吴浈回应说：“如果这个问题是我说YES OR NO就可以回答的，那么论坛马上就可以结束。”分论坛结束后，不少记者涌向台前继续追问，但是对于大部分问题，吴浈都没有直接回答。

吴浈2006年9月由江西进京、出任国家食品药品监督管理局副局长时，郑筱萸时任国家食品药品监督管理局局长。三个月后，郑筱萸被“双规”，2007年5月被执行死刑。

吴浈的名字以证人身份，出现在了郑筱萸的判决书中。

郑筱萸的判决书显示，2000年，郑筱萸要求对广东某公司申请药品零售跨省连锁经营一事予以支持。2003年，郑筱萸视察该公司时，该公司负责人就办理《药品经营许可证》一事，请托郑筱萸帮忙。郑筱萸指示时任江西省食品药品监督管理局局长的吴浈，向国家食品药品监督管理局行文请示，由国家食品药品监督管理局批复解决。

也就是说，在郑筱萸一案中，吴浈曾作证，郑筱萸接受了广东某公司的请托、帮其办事。

郑筱萸落马后，吴浈曾数次公开表态，认为不能因为郑筱萸等少数几个人的问题，否认整个药监系统。

2007年2月，做客中国政府网、跟网友交流时，吴浈说：我这里想说一下，尽管我们药监系统出现了像郑筱萸、曹文庄等人的腐败案件，但是不能因为他们几个人的问题否认药监这支队伍，也不能否认药监系统这么多年来所做的工作和取得的成绩，也不能动摇我们做好监管工作、为民把关的信心。

2007年12月，在国新办的新闻发布会上，吴浈说，“郑筱萸已经受到法律的严惩，其结果新闻已经报道了，我想大家都已经知道了。郑筱萸的腐败案件对药监系统产生了一些负面影响，让我们药监人蒙羞，我们对此是痛心的。”

吴浈当时还表示：不能因一个人的问题，否认一个系统、否认这支队伍，我很有信心地告诉大家，中国食品药品监管的这支队伍是好的，这支队伍是能吃得起苦，能敢于碰硬，是有战斗力的一支队伍。