根据中央统一部署，2016年11月6日至2017年1月5日，中央第十一巡视组对重庆市开展了巡视“回头看”。

2017年2月11日，中央第十一巡视组向重庆市委反馈巡视“回头看”情况。

时任中央第十一巡视组组长徐令义指出，巡视中，巡视组发现和干部群众反映了一些问题，主要是：党的领导弱化，担当意识不强，学习贯彻中领导人总书记系列重要讲话精神有差距，统筹推进“五位一体”总体布局有偏差，选人用人把关不严，一些干部“带病提拔”。党的建设缺失，市委以上率下抓得不够“严”，党口部门和区县党委抓得不够“专”，基层党组织抓得不够“实”。全面从严治党不力，“两个责任”落实不到位，一些重点领域腐败问题突出，一些领导干部十八大后不收敛不收手。上轮巡视发现的一些重点问题整改不到位，清除“薄、王”思想遗毒不彻底，国企腐败形势依然严峻，违反中央八项规定精神问题没有得到有效遏制。同时，巡视组还收到反映一些领导干部的问题线索，已按规定转中央纪委、中央组织部等有关方面处理。

7月15日，新华社发布消息，孙政才不再兼任重庆市委书记、常委、委员职务。陈敏尔任重庆市委委员、常委、书记。

7月24日，新华社发布消息，鉴于孙政才涉嫌严重违纪，中共中央决定，由中共中央纪律检查委员会对其立案审查。

陈敏尔担任重庆市委书记以来，多次在不同场合强调，要清除孙政才恶劣影响和“薄、王”思想遗毒。

10月9日，重庆市委常委会召开会议，研究部署近期全市重点工作。陈敏尔指出，要切实履行管党治党的政治责任，一刻不松、半步不退地将全面从严治党长期坚持下去，大力加强党的领导和党的建设，坚决清除孙政才恶劣影响和“薄、王”思想遗毒，坚决防止出现“七个有之”问题，努力营造风清气正的良好政治生态。

10月19日下午，出席中共十九大的重庆市代表团在人民大会堂重庆厅举行开放日活动，继续讨论党的十九大报告，陈敏尔和重庆市长张国清发言并回答记者提问。

在被问及“孙政才严重违纪，给重庆造成了哪些危害和影响？重庆既面临清除孙政才恶劣影响，还面临肃清‘薄、王’思想遗毒的任务，下一步市里将采取怎样的措施？”时，陈敏尔回答到：党中央对孙政才严重违纪案的处理决定，完全正确，非常英明，十分及时，是我们党反腐败斗争坚如磐石的决心、意志、力度的充分体现。重庆市委和全市广大党员干部、群众坚决拥护中央决定，迅速把思想统一到党中央的决定精神上来。孙政才严重违纪案给党的形象和事业造成很大危害，给重庆改革发展稳定造成重大损害，给全市广大干部群众造成了极大伤害。我们要按照党的十九大部署，坚定不移全面从严治党，把党的政治建设摆在首位，严肃党内政治生活，坚决清除孙政才恶劣影响和“薄、王”思想遗毒，持之以恒正风肃纪，夺取反腐败斗争的压倒性胜利。一是把清除孙政才恶劣影响与肃清“薄、王”思想遗毒结合起来，全面、干净、彻底清除恶劣影响。二是把“破”与“立”结合起来，把恶劣影响破除掉，把正确的思想、优良的作风、良好的导向、正面的典型立起来，推动形成良好政治生态。三是把说清道理与多干实事结合起来，扎扎实实为群众办好事、做实事，让老百姓有实实在在的获得感、幸福感、安全感。

11月21至22日，陈敏尔前往重庆市委政法委、市高法院、市检察院、市公安局、市司法局等调研我市政法工作，并召开学习贯彻党的十九大精神政法工作部门座谈会。陈敏尔强调，要认真贯彻“五个过硬”要求，建设一支信念坚定、执法为民、敢于担当、清正廉洁的新时代政法队伍。要坚决清除孙政才恶劣影响和“薄、王”思想遗毒，营造风清气正的良好政治生态。

12月14日，重庆市委常委会召开会议，深入贯彻中领导人总书记关于进一步纠正“四风”、加强作风建设的重要指示精神。陈敏尔主持会议并讲话。

会议指出，八项规定改变中国，作风建设永远在路上。中领导人总书记关于作风建设的重要指示，一针见血、切中时弊，内涵丰富、要求明确，充分表明了以中领导人同志为核心的党中央坚定不移全面从严治党、持之以恒正风肃纪的鲜明态度和坚定决心。要认真学习贯彻总书记重要指示精神，以永远在路上的坚韧锲而不舍抓好作风建设，把进一步纠正“四风”与坚决清除孙政才恶劣影响和“薄、王”思想遗毒结合起来，推动全市党风政风持续向好。